2004年，东大设计院按照ISO9001：2000国际质量标准建立了质量管理体系，2009年建立了ISO9001：2008质量管理体系，并取得了ISO9001国际质量体系认证证书。

2012年，东大院按照OHSAS18001：2007标准建立了职业健康安全管理体系，按照ISO14001：2004标准建立了环境管理体系；2013年按照OHSAS18001：2011标准建立了职业健康安全管理体系，并取得了认证证书。